במהלך הניתוח יוצרים כיס קטן בחלקה העליון של הקיבה שיכול להכיל רק מספר כפות של מזון. שאר הקיבה נשארת בגוף אך אינה משתתפת יותר בתהליך העיכול. הכיס מחובר ישירות למעי הדק, תוך דילוג על חלק מהקיבה והמעי. הדבר מגביל את כמות המזון הנצרכת ואת ספיגת הקלוריות.

כמו בכל ניתוח, ישנם סיכונים הקשורים להרדמה, דימום או זיהום. מעקף קיבה כולל גם סיכונים לדליפה באזור החיבור, חסימת מעי, קרישי דם או תסמונת ההטחה ("dumping syndrome") – תסמינים כמו חולשה, הזעה ושלשולים לאחר אכילה מהירה מדי או צריכת כמות גדולה של סוכר. עם זאת, הסיבוכים חמורים נדירים ברוב המקרים.

האשפוז בשיקום נמשך בדרך כלל יום עד יומיים. לאחר מכן מומלץ כשבועיים מנוחה בבית. החזרה לתזונה רגילה נעשית בהדרגה, ותוך 4–6 שבועות רוב המטופלים חוזרים לפעילות מלאה. במהלך התקופה יש חשיבות רבה לליווי תזונתי ומעקב רפואי.

כן, מעקף קיבה הוכח כיעיל מאוד בשיפור או אף בריפוי של סוכרת סוג 2. בזכות השפעתו על הורמוני מערכת העיכול, רמות הסוכר בדם יורדות באופן דרמטי כבר בימים הראשונים לאחר הניתוח – עוד לפני הירידה המשמעותית במשקל.

רוב המטופלים מאבדים כ-70–80% ממשקלם העודף. הצלחה לאורך זמן תלויה בשמירה על אורח חיים בריא. עם תזונה נכונה, פעילות גופנית וליווי מקצועי – בהחלט ניתן לשמר את התוצאות למשך שנים רבות.